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解密霍亂基因組學歷史!國際頂尖機構聯手發表兩篇Science

霍亂作為一種古老的疾病, 對人類帶來過巨大災害。 僅19世紀以來, 全球發生了七次霍亂大流行, 造成數百萬人死亡。 即使從今天看,

它仍然影響著世界上47個國家, 每年有將近10萬人死於這一疾病。

11月10日發表在Science上的兩項研究成果, 融合了全基因組測序和流行病學, 來估計引起霍亂流行的不同霍亂菌株的風險。

不同大陸有不同霍亂菌的變種

上述研究中, 科學家們分析了1200多個霍亂樣本的遺傳資料, 這些資料了來自世界各地的歷史性霍亂樣本, 可追溯到上世紀50年代。

研究人員把重點放在非洲和拉丁美洲, 因為這些地區發生了大量流行病:第七次霍亂大流行於1970首次來到非洲, 從此非洲成為受該疾病影響最嚴重的大陸;霍亂在1991年後出現在拉丁美洲, 100年後出現在美國。 研究人員分別發表了非洲和拉丁美洲霍亂研究的兩篇文章以表明:大陸之間存在著驚人的多樣性;拉丁美洲和非洲有不同的霍亂毒素變種,

它們的傳播動力和生態位是不同的。

在非洲

在關於非洲的研究中, 研究小組發現:目前正在進行的從上世紀60年代開始的大流行, 是由一個單一種系的霍亂弧菌引起的, 稱為7PET。 此後不斷被引入非洲的兩個主要區域——西非和中東/南部非洲。

非洲研究文章(Genomic history of the seventh pandemic of cholera in Africa)的第一作者François-Xavier Weill說:“我們的研究結果表明, 各種7PET菌的新版本自上世紀70年代以來進入非洲。 一旦被引入, 霍亂暴發遵循類似的路徑時在非洲大陸蔓延。 這一結果讓我們有了一個想法, 即我們可以針對非洲的那些特定地區加強監測和控制。 ”

科學家們還研究了霍亂中抗生素耐藥性的演變。 研究小組發現, 最近進入非洲的霍亂細菌已經對抗生素產生了耐藥性。

利用基因組資料, 他們能夠追溯到抗生素耐藥性的來源是南亞。

在拉美

在拉丁美洲的研究文章中, 研究團隊不僅著眼於7PET菌株引起的傳染病, 也包括霍亂弧菌的其他株引起的散發性低水準疾病。 他們發現, 霍亂弧菌的不同菌株可以被賦予不同的風險, 導致大暴發。 這對全世界的霍亂控制工作有重大影響。

拉丁美洲研究文章(Integrated view of Vibriocholeraein the Americas)的第一作者Daryl Domman說:“我們的資料表明, 當一個7PET流行病株從其他地方進入拉丁美洲, 它可以造成大規模的流行, 就像1990年在秘魯和2010年在海地那樣。 然而, 我們現在知道, 已經存在這個地區的其他菌株仍然可以使人生病, 但似乎沒有這種流行病的潛力。

瞭解是哪種病菌造成的, 能使區域或國家政府做出適當的公共衛生反應。 ”

意義和應用價值

文章通訊作者, 來自Wellcome Trust Sanger研究所和倫敦大學的Nick Thomson教授說:“這些研究結果會為霍亂大流行的控制產生影響。 我們現在真正瞭解了霍亂是如何在全球各地傳播的。 通過掌握這些資訊, 我們可以瞭解基礎科學上的知識以及改進的控制策略, 以便更好地瞭解一種對人類健康構成如此威脅的簡單的細菌。 ”

參考資料

2) Integrated view of Vibrio choleraein the Americas

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